处理完蔡邕的事，王允面对着如何解决凉州军的问题。当时有两种意见，一种认为让老将皇甫嵩重新出山，统帅凉州军，以皇甫将军的威名，应该可以镇住他们；另一种意见认为应把凉州军全部杀掉。前一种意见占大多数，持后一种意见的，是吕布等并州派。
并州派想借用士人和社会力量趁机消灭凉州派，然后自己独霸朝廷。王允没有采纳吕布的主意，但自己又是个没有主见的人，他一会儿想赦免凉州将领的罪过，一会儿又想下令解散凉州军，弄得外面谣言四起，都说王允要大开杀戒，最少要杀十万人。
后来王允决定还是解散凉州军，马上有人表示异议，说如此一来凉州军人都会人人自危，天下必乱。
然而王允认为，关东联军是自己的盟友，现在董卓死了，还把大军驻扎在函谷关、陕县一带，必然让盟友疑心。他坚持将凉州军就地解散。
凉州军人都在想，蔡邕那样的人王允尚且不放过，现在我们要是被解散了，马上就会成为任人宰割的鱼肉。所以，当李肃带人拿着诏书到陕县宣布解散凉州军的时候，牛辅等人起兵反抗，李肃大败而回。吕布斩杀了李肃，亲自迎战牛辅。
还没等吕布动手，牛辅自己先出了事。晚上大营里发生夜惊，全营一片混乱，牛辅心惊胆颤，准备只身逃走，结果被手下人干掉了。
李、郭汜、张济等凉州大将听说牛辅被攻，急忙驰援陕县，到达后牛辅已死。李等人没了主意，派人到长安向王允请降，王允既没有立即同意，也没有说不能赦免。他的回答很有意思：“一年之内，不能有两次赦令。”
本年的正月里曾经大赦过一次，一年不能有两次大赦，这倒也是制度规定。王允这时候变成了遵章守纪的模范，只不过在此时这非常不合时宜。
李等人六神无主了，他们原来都是跟着董卓混世界的，所有的大主意都由董卓拿，他们只管打打杀杀，他们既来不了文的，也搞不了政治，只想荣华富贵，能过上花天酒地的生活。现在领路人董卓、牛辅都死了，他们还真不知道怎么办好。
既然人家不愿意现在赦免他们，等明年可以颁布赦免令时再打报告上去的话，这中间还有大半年时间，显然不大可能。李等人简单商议一下，决定让队伍自行解散，大家化整为零绕道逃回家乡凉州。
这时候，原牛辅所部的一个师长（讨虏校尉）出来对大家说，这样做万万不可。他警告道：“如果分散突围，必然会个个击破，不如向西进攻长安，给董太师报仇，事情成功可以拥戴皇上，号令天下；事情不成，再跑也不迟。”
他一下子把大家说醒了：是呀，跑什么呀，咱们实力也不差，干嘛求人呢？于是集齐人马，大家向西挺进。
出这个主意的人叫贾诩，字文和，凉州刺史部武威郡人，此时四十五岁，比曹操大八岁。
贾诩早年也被举孝廉为郎，后因有病辞官回武威郡老家，路上遇见氐人，与其同行的几十个人全部被抓。抢完东西之后，氐人要把他们活埋。贾诩骗他们说：“我是段太尉的外孙，你们别埋我，我家必然拿钱来赎。”段太尉即“凉州三明”之一的段，大名威震西土，贾诩拿这话吓唬氐人，氐人果然不敢害他，还与他磕头拜把子，送他回去。
董卓当了太尉以后，贾诩以凉州出身的缘故被聘为太尉府里的处长（太尉掾），后来升为黄河上的平津渡口守卫司令（平津都尉），再升为师长（讨虏校尉），驻扎在陕县一带，归牛辅指挥。
后世多认为，贾诩的这个主意闯下了大祸，使得有可能出现的和平契机化为乌有，令帝国再次陷入混乱状态。
裴松之注《三国志·贾诩传》的时候忍不住评论说：这个时候，元凶已除，天地始开，但随之国家又四分五裂，黎民百姓再次遭受涂炭，这一切难道不都是因为贾诩的一句话吗（岂不由贾诩片言乎）？贾诩的罪过，竟然如此之大！
将天下重新陷入动荡的罪过全部归于贾诩一人，未免夸大了他那一句话的作用。没有贾诩，天下该乱还会乱，只不过，此时此刻，他的一个主意至少改变了局部事态的发展。李等人率兵杀来，路上凉州军越聚越多，除李、郭汜、张济、贾诩外，樊稠、李蒙等凉州将领也来加入，人数达十多万。此时长安的守军也就一两万人而已，形势危急。
偏偏这个时候，守军里有人反水，这是一支特殊的部队，名叫“叟兵”。
叟人是西南的一个少数民族，叟兵以打仗勇猛而著称，这支叟兵人数不详，可能是益州牧刘焉派来的。这伙人打仗有一套，战场上随机应变更有一套，作为川军里的雇佣军团，他们犯不着跟别人一块送死。
王允、吕布等人守了八天，叟兵打开城门，凉州军杀入长安。吕布不敌，带领几百名骑兵杀出城去，这一行人里，应该有张辽、高顺等人。吕布临走时不忘把董卓的人头挂在马鞍上，这个东西他见着袁术、袁绍时还用得上。
吕布路过青琐门的时候，招呼王允一块走，王允不想走，就请吕布带话给关东诸位首领，要他们设法来救皇上。
太常卿种拂、太仆卿鲁馗、大鸿胪卿周奂、城门校尉崔烈、越骑校尉王颀等大臣在混乱中被杀，和他们一同被杀的有一万多人。司徒王允、司隶校尉黄琬、左冯翊郡太守宋翼、右扶风郡太守王宏等被抓，几天之后一块儿被凉州军处死。
李胁迫献帝任命自己为扬武将军，郭汜为扬烈将军，樊稠为中郎将。三个月后李又任车骑将军兼司隶校尉，郭汜、樊稠分别为右将军和后将军，他们三个人组成领导小组共同主持朝政（朝政）。张济为骠骑将军，出屯潼关以东的弘农郡一带。
与凉州集团关系密切的韩遂、马腾等人听说长安大乱，也带兵前来凑热闹，看能不能混水摸鱼。“三人小组”任命韩遂为镇西将军，屯驻金城（今甘肃兰州）；任命马腾为征西将军，屯驻董卓昔日苦心经营的大本营坞。
这些多年来与朝廷水火不容的叛军，被正式任命为朝廷的高级将领。此时同在长安的皇甫嵩，以及将要来到长安的朱俊等老将看了之后想必无言以对。
凉州军人又把持了朝政，和平的曙光虽曾一闪，但再次与帝国无缘。接下来，将是无休无止的混战。