李斯现在过着两点一线的生活，从刑房到囚室，再从囚室到刑房。狱卒们慑于赵高的严命，用刑唯恐不狠，下手唯恐不重，非要打得李斯亲口承认谋反不可。
古罗马人曾经说过，严刑之下，能忍痛者不吐实，不能忍痛者吐不实。蒙田亦云：刑讯不足考察真实，只可测验堪忍。
忍痛所以难，不仅难在生理上，更难在精神上。像李斯这样意志力强大的人，对疼痛的忍耐能力，应该说是远远高于常人的。但另一方面，他所接受的残忍刑罚，也是常人无法想象的。在一轮又一轮永无休止的重刑之下，李斯再也坚持不住，他屈服了，他承认了。而狱卒们浑不理会他身心的痛苦，犹然说着风凉话，道，“你早承认不就完了，何必平白遭这许多罪呢。”
考诸史册，李斯乃是中国历史上被屈打成招的第一人。只是，这样的纪录，对李斯来说，耻莫大焉；对帝国来说，也并不光荣。
闻知李斯招供，赵高大喜，但他却没有急着向胡亥报告表功。按照帝国法律，终审权还是掌握在胡亥手上，李斯招供之后，胡亥必然派人前来复审。如果李斯到时候突然翻供，拒不承认谋反，虽说李斯未必一定能因此而咸鱼翻生，但至少也将给赵高平添无数麻烦。
所以，赵高必须彻底打消李斯翻供的念头。于是，赵高按照条件反射的法则，对李斯进行了科学的调教。
赵高找来一位门下宾客，命其假扮胡亥派来的御史，前去复审李斯。假御史到得监狱，支开旁人，对李斯说道，“臣奉陛下之命前来，此间无人，丞相如有冤屈，尽可以实相告。”
自从入狱以来，这是李斯听到的第一句温暖的、有人味的话。李斯激动得热泪盈眶，胡亥终于派人来了。长久的刑罚已经让李斯变得脆弱，变得轻信，他根本就没有怀疑眼前这人的身份可能有假，而是将他当作一根救命稻草，牢牢抓住，再也不肯放手。
李斯执假御史之手，大哭道，“请君一定要转告陛下，李斯是冤枉的，李斯是忠臣啊！”又细诉自己对帝国的功勋和赤诚。假御史并不留心去听，只是偶尔嗯上一声，聊作应付。
假御史前脚离去，狱卒后脚进来，对李斯劈头就是一顿乱棍，边打边训斥道，“叫你胆敢翻供，叫你胆敢翻供！”
李斯吃痛不过，只能抱头求饶，道，“别再打了，我再也不翻供了。”
赵高仍不放心，再派一位宾客假扮谒者，谎称奉胡亥之命，复审李斯。李斯犹不醒悟，又在假谒者面前自诉冤枉。李斯激愤不已，泪尽而泣之以血。假谒者见状心中恻然，却也爱莫能助。
假谒者一出，狱卒再次进来，对李斯又是一阵狠揍。
就这样，赵高先后派了近十拨人，冒充胡亥的使者来试探李斯。李斯不辨真伪，每每翻供，自陈冤情。随后，照例要挨上一顿棍棒或鞭挞。
像巴甫洛夫著名的实验那样，李斯也形成了这样的条件反射：只要他一翻供，就必然要遭受毒打。他实在是不想再挨打了，他实在是宁愿死。
假作真来真亦假。等到胡亥真的派人前来复审之时，李斯再也不敢相信眼前这人真是胡亥的使者，他只是一味地重复道，“我有罪，我欲反。”
使者回报胡亥，胡亥不仅不会想到是赵高在暗中下了手脚，反而对赵高大赞道：“如无赵君，几为丞相所卖。”
不久之后，胡亥派往三川搜集李由通敌证据的使者也回到了咸阳。对李斯来说，使者带回来了一个好消息和一个坏消息，而这好消息和坏消息，其实又是同一个消息——李由在前方英勇抗敌，虽寡不敌众，也拒不投降，最终为项羽和刘邦的联军所破，死于曹参之手。
老年丧子，自然是再坏不过的消息。然而，李由在前线顽强战斗，为国捐躯，堪称帝国的英雄，关于他通敌的指控自然也就不攻自破。李由以他的壮烈牺牲，证明了李斯全家的无罪，却也算得上是好消息了。
可惜的是，李由的牺牲，依然无法拯救他全家的命运。此时的朝廷之中，赵高已经一手遮天，无所不能。日后他可以指鹿为马，现在他也能颠倒黑白。在赵高的威逼利诱之下，使者也只得捏造事实，上奏胡亥道，“李由通敌，确有其事。”
至此，胡亥对李斯谋反一事再无任何疑心，于是命赵高为李斯量刑。
赵高奏道，“李斯位居三公，不思报国尽忠，而起不臣之心。人臣之罪，莫过于此，非重惩不足以安天下，镇万民。判曰：李斯具五刑，诛三族。”
具五刑，按《汉书·刑法志》，具体内容为“先黥，劓，斩左右趾，笞杀之，枭其首，菹其骨肉于市。其诽谤詈诅者，又先断舌。”即便是在严酷的秦法之中，具五刑也称得上是最残忍的一种刑罚。
胡亥接奏，喟然叹道，“李斯侍奉先帝数十年，于我秦立有大功，此天下共睹，不容忘却。如无李斯，朕也不能有今日人主之尊。知恩不报，非人也。量刑如此之重，朕心实不忍。”
赵高面白如纸，满心惶恐，听胡亥这意思，莫非他要宽恕李斯，饶李斯不死？果真如此，那可就全完了。胡亥一句话，就可以让他在审判李斯时所使的种种伎俩，全变成了白费心机。李斯已经明白过来，都是赵高在设计陷害他，一旦李斯死里逃生，全力反扑，他赵高又将如何抵挡？
赵高搜肠刮肚，酝酿着自己的说辞，准备劝谏胡亥维持原判，胡亥却已接着说道，“改具五刑为腰斩，其余如君所奏。”
赵高大喜，恨不能抱住胡亥，娇声嗔道，“你早说嘛，害得人家的小心肝噗噗地跳。”
总之，无论是具五刑还是腰斩，李斯终究还是一死，而且同样死得毫无体面可言。或许，在胡亥眼中，将具五刑改成腰斩，虽然是换汤不换药，却已经是他仁慈的最大限度了。